분자동역학 전산모사 해석 컴퓨터 2set 구매

구매 규격서

COMMODITY DESCRIPTION

품목번호 Item No.	관세분류번호 HSK No.	정부물품분류번호 (8자리) Korean Government Commodity Classification Code (eight-digit)	품 명 Description	단위 Unit	수량 Q'ty
1		4321150102	분자동역학 전산모사 해석 컴퓨터	set	2

Ⅰ. 용도(End-user's Use)

- 분자동역학 전산모사 해석용 고성능 계산 클러스터

Ⅱ. 물품의 구성(Configurations of Goods)

A. Computation Node 2 식

B. HPCC Environment Driver 1 식

Ⅲ. 성능 및 규격(Performance and Specificpation)

■ Computation Node (총 2 set)

1. FORM FACTOR : 1U Rack 타입, CMA 및 Tool-less 슬라이드 레일 포함

2. CPU : 2 x 2.9GHz 24-Core 60MB Cache 동등 이상 제품

 * 중소기업자간 경쟁제품 지정 규정에 의거하여 “직접생산확인증명서” 제출 필수

3. RAM : 2 x 16GB DDR5-4800 RDIMM 동등 이상 (32 DIMM 슬롯 보유)

4. DISK BAY : 4 x Hot-swap 드라이브 베이 이상

5. SSD : 1 x 240GB TLC Enterprise 급 이상 SATA/NVMe SSD

6. MANAGEMENT : 독립적인 KVM over IP 지원 관리 모듈 탑재

7. NETWORK : 2 x 10Gb/s Base-T 이상 또는 동등 성능 고속 네트워크 카드 탑재

8. POWER : 2 x 1600W (1+1) Redundant 고효율 Hot-swap 파워 서플라이

■ HPCC Environment & Driver

1. HPCC 운영 소프트웨어: 리눅스 기반 운영체제(Rocky Linux, Ubuntu 등) 및 개발 툴셋 구축

2. Development Tool, Library, Job Manager: SLURM, Torque, PBS Pro, SGE 지원 및 연동

3. HPCC Environment (다음 소프트웨어 및 크로스 컴파일 지원):

가. GNU, Intel oneAPI, PGI, Open64 컴파일러

나. OpenMP 전역 배열, Open MPI, MPICH, MPICH2, MVAPICH, MVAPICH2

다. Intel oneAPI MKL BLAS and LAPACK with DPC++

라. Intel oneAPI VTune, oneAPI MPI, oneAPI Trace Analyzer & Collector

마. Intel oneAPI Threading Building Blocks, oneAPI Cluster Checker

4. HPCC 관리 소프트웨어:

가. 공통 관리 기능: 노드 제어, 노드 프로비저닝, 노드 자원 모니터링, 경보 설정, 병렬 쉘, 대기열

작업 제어, 사용자 관리(LDAP 서버 연동), 역할 기반 인증, GPU 컴퓨팅 관리, 클러스터 상태 검

사, 클러스터 전원(PDU) 관리, 소프트웨어 이미지 관리 기능, 그래프 모니터링, 랙 상태 및 스위

치 시각화 모니터링

나. 클러스터 관리 명령어 일괄 수행 (재부팅, 프로비저닝, 전원 On/Off 등)

다. GUI 및 CLI 지원: 단일 환경의 GUI 및 CLI를 통해 모든 공통 관리 기능을 제공하고, 다중 클러

스터 동시 관리 기능 지원

라. 장애 조치(Failover): 외부 소프트웨어 도구가 필요 없는 기본 내장 기능 지원 (헤드 노드의 HA

구성 지원 가능 구조)

마. 클러스터 자동화 및 그래픽 모드 상에서 클러스터 설치 및 프로비저닝 수행 가능

바. 워크로드 관리: 병렬 미들웨어 런타임 환경과 통합하여, 응용 프로그램에 대한 올바른 계정, 자

원 제한 및 프로세서 할당 기능 제공

■ HPCC 사용자 포털 (User Portal)

1. Web Interface 기반 통합 사용자 Portal 제공

2. 파일 관리 기능 (웹 브라우저 상에서 파일 브라우징, 전송, 편집, 복사 및 붙여넣기 지원)

3. Job Manager 연동 기능 제공 (SLURM, Torque, PBS Pro, SGE 지원 및 모니터링)

4. 기본 Job 스크립트 템플릿 제공 및 작업 제출/관리 기능

5. 웹 브라우저 내 인라인 SSH 터미널 및 VNC 가상 데스크톱(GUI 환경) 지원

6. LDAP 연동 통합 사용자 인증 메커니즘 지원

■ HPCC 보안 및 네트워크 설정

1. 노드 및 클러스터 내부 방화벽(Firewall) 최적화 설정

2. 연구실 외부 접속 관리를 위한 보안 VPN 설정 지원

■ 동역학 및 양자화학 시뮬레이션 프로그램 설치 및 최적화

1. 물성 분석, 분자 시뮬레이션 및 양자화학 협업에 필요한 하기 소프트웨어군에 대한 최적화 컴파일

및 설치를 지원해야 하며, 사용자 요청 시 최신 안정화 버전(Latest Stable Version) 구축을 원칙으

로 한다.

2. 재료 및 전자구조 계산 소프트웨어 (DFT / Quantum Chemistry)

가. Material Studio (FORCITE, DMol3, CASTEP 등)

나. VASP (Vienna Ab initio Simulation Package)

다. Quantum ESPRESSO, WIEN2k, CPMD, ORCA

라. Amsterdam Modeling Suite (구 ADF)

3. 분자 동력학 및 구조 시뮬레이션 (Molecular Dynamics / Monte Carlo)

가. GROMACS, LAMMPS, NAMD(+VMD), CHARMM, CP2K

나. DL_POLY, TeraChem

다. Monte Carlo BOSS, Spartan, Rosetta Software Suite

4. 물성 분석 및 후처리 툴킷 (Analysis / Post-Processing / Math)

가. PLUMED, Phonopy, CatDCD, g_mmpbsa

나. MATLAB, Mathematica

5. 인공지능 및 머신러닝 기반 시뮬레이션 프레임워크 (AI / ML & Deep Learning)

가. Python 기반 오픈소스 머신러닝 라이브러리 (PyTorch, TensorFlow)

나. 머신러닝 기반 분자 동력학 포텐셜 패키지 (DeepMD-kit, TorchMD 등)

6. 상기 소프트웨어를 향후 구축될 통합 분석 파이프라인에 사용하기 위한 패키지 형태로 변환 시

최상의 연산 환경을 제공할 수 있도록 최적화하여 설치될 수 있도록 기술 지원해야 함.

7. 사용 예정인 시뮬레이션 프로그램들이 도커(Docker) 혹은 싱귤래리티(Singularity)를 활용하여 다양

한 OS(Fedora, Ubuntu, Rocky Linux/CentOS) 환경에서 정상적으로 구동되도록 설치 지원 및 이미

지 빌드, 배포 관리(모니터링) 할 수 있는 컨테이너 기반 운영 방법과 클러스터 작업 제출을 위한

스크립트(SLURM, PBS 등) 등을 제공해야 함.

Ⅳ. 기타 조건(Remarks)

1. 납기조건: 발주 후 30일 이내

2. 하자보증조건: 장비 검수 및 설치 완료 후 1년 (하드웨어 및 시스템 소프트웨어 기술 지원 포함)

3. 납품 장소: 경기대학교 지정 장소

4. 계약 조건: 공동계약 불가, 하도급 불가 (정보기반 인프라의 보안 및 기술 연속성 유지 목적)

5. 기존 클러스터 시스템과의 유기적인 호환 운영 및 스케줄러 연동이 가능하도록 설치하고, 신규 노

드에 최적화된 OS 및 시뮬레이션 SW 컴파일 기술 지원을 완수해야 한다.

6. 장비 납품 및 설치 전, 계약 상대자는 반드시 현장 실사를 통하여 기 구축된 서버 환경 및 전력/

공조 설비를 확인해야 하며, 현장 실사 미이행으로 인해 발생하는 설치 지연 및 시스템 연동 불가

의 책임은 전적으로 납품사에 있다.

7. 납품 및 설치 완료 후, 관리자 전용 클러스터 운영 교육 및 사용자 대상의 작업 제출/포털 활용

교육을 실시해야 한다.

8. 계약 상대자는 「중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률」 제9조 및 동법 시행령 제10조

규정에 의거, 직접생산확인증명서(G2B 물품분류번호 10자리: 4321150102 “컴퓨터서버” 및

4321159401 “특수목적컴퓨터”)를 모두 소지한 업체여야 한다.

9. 국가 공공기관 및 국립대학의 정보보안 가이드라인에 의거, 백도어 및 불법 데이터 유출 등 잠재

적 보안 위협 우려가 있거나 국가정보원 등 관계 기관에서 보안 취약성을 경고한 특정 해외 제조

사 부품(OEM, ODM 포함)을 채택한 시스템은 본 도입 건에서 제외한다.

10. 계약 상대자는 「정보통신공사업법」 제14조에 의거하여 정보통신공사업(업종코드: 0036) 등록을

필한 업체여야 한다.

11. 계약 시 하드웨어 안정성 신뢰 확보를 위해 제조사 및 공식 총판 발행 “정품공급확약서

(Manufacturer's Authorization Form)” 및 “기술지원확약서(Technical Support Confirmation)”를 제

출하여 비공식 유통 부품 반입을 차단하고 사후 공식 A/S 채널을 보장해야 한다.

12. 본 구매규격서에 명시되지 않은 기술적 사항 및 의문점은 발주기관 담당자와 상호 협의하여 결

정하며, 협의가 원활하지 않을 경우 발주기관의 해석 및 결정에 따른다.