고분자 시뮬레이션을 위한 고성능 컴퓨팅 시스템 구매

捤獥 汤捯 [별지 제3호 서식]<개정 2013.05.14.,2019.07.04.>

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상 세 규 격 서

요구 번호 :

품 명

국 문 :

GPU 서버

영 문 :

Linux Cluster Server

구 분

상 세 명 세

수 량

비 고

1. Feature

고분자 시뮬레이션, 에너지 시스템 모델링 및 예측 모델링 결과 분석을 위한 고성능 Linux Cluster Server

Intel Xeon 6 Granite Rapids 기반 Dual Processor 시스템으로 고속 병렬 연산 환경 제공

클러스터 노드 간 100Gbps InfiniBand 고속 네트워크 환경을 통한 병렬 계산 성능 향상

HOOMD-blue, LAMMPS, GROMACS 등 분자동역학 및 고분자 시뮬레이션 프로그램 구동 지원

C/C++/Fortran, Python, R 및 MPI 기반 병렬 계산 환경 지원

NVIDIA CUDA 기반 GPU Computing 및 Machine Learning / Deep Learning 환경 지원

JupyterHub 및 RStudio Server 기반 다중 사용자 Web 개발 환경 지원

Slurm, OpenPBS, Torque 또는 SGE 기반 Cluster Job Scheduling 및 시스템 모니터링 환경 지원

기존 클러스터 서버 및 InfiniBand 환경과 연동 가능한 확장형 HPC 시스템

2

2. Specification

① Main System

1) Processing Unit

Intel Xeon 6 Granite Rapids Series

Intel Xeon 6527P, 24 Core, 3.0GHz, 144MB Cache × 2 Processors

Dual Socket Processor Architecture

2) Memory Unit

64GB DDR5 Memory (32GB × 2)

DDR5-6400MHz

32 DIMM Slots

Maximum Memory Capacity : 4TB

3) Storage Unit

8 × 2.5" SAS / SATA SSD Hot-Swap Drive Bay

OS Mirror : 960GB 12Gbps SATA SSD × 2EA

Hardware RAID Controller

PERC H755 RAID Controller 또는 동등 이상

8GB NV Cache

RAID 1 기반 OS Disk 구성

4) System Architecture

2U Rack Mount Type Server

2400W Hot-Swap Redundant Power Supply

LCD Bezel

Dual Port 10Gb Ethernet Interface

PCIe Riser Kit

GPU Installation Kit

Remote Server Management Interface (iDRAC Enterprise 또는 동등 이상)

5) Cluster Network

100Gbps InfiniBand 기반 Cluster Interconnection

기존 Cluster Server 및 InfiniBand Network와 연동 구성

병렬 계산 및 MPI Communication 환경 구성

6) Operating System

Rocky Linux 8

(Red Hat Enterprise Linux 8 Compatible)

7) Compiler & MPI Environment

Intel oneAPI Base Toolkit & HPC Toolkit

NVIDIA HPC SDK Toolkit

MVAPICH, MPICH, OpenMPI

C, C++, Fortran Compiler 및 개발 환경 구성

8) Scientific Computing Environment

Python 및 Data Analysis Library

(NumPy, SciPy, Pandas, Matplotlib 등)

R 및 Data Science Package

JupyterHub

RStudio Server

NetCDF v3/v4, HDF4, HDF5

NCL-NCARG, ncview, NCO, OpenGrADS

GMT, Ferret, CDO, UDUNITS 등 과학계산 Library 구성

9) Cluster Scheduler & Management

Slurm / OpenPBS / Torque / Sun Grid Engine 중 요구 환경에 맞는 Scheduler 구성

Firewall 및 병렬 Command 관리 환경

htop, nmon, modules, nvtop

HPC Cluster Monitoring 환경

Ganglia Web Monitoring

NTP Server 및 시간 동기화

Server Hardware Management Software 구성

10) GPU Computing Environment

NVIDIA Driver

CUDA Toolkit & cuDNN

NVIDIA Container Toolkit

PyTorch, TensorFlow, Keras 등 Machine Learning / Deep Learning 환경 구성

11) Application & Integration

HOOMD-blue, LAMMPS, GROMACS 설치 및 구동 환경 구성

기존 Cluster Server 연동 및 Rack 구성 최적화

기존 InfiniBand 환경 연동

고분자 시뮬레이션 및 모델링 실행 환경 구성

Storage 및 Cluster Computing Environment 구성

② Option

1. 3년 무상 서비스(하드웨어 & 소프트웨어)

2. 시스템 사용자 및 관리자 교육(Hoomd, Lammps,Gromacs 관련 교육 2회)

3. 시스템 운영 및 관리자 매뉴얼 제공

4. 기존 사용중인 클러스터 서버 포함 연동 랙 빌더 최적화 작업

5. 기존 클러스터 서버 IB 환경 설치 및 고분자 시뮬레이션 모델링

Install 작업 및 스토리지 구성 작업

6. 납품전 실행모델 (HOOMD, Lammps, Gromacs,) 완벽하게 구동 결과값 제출 이 검수 조건임

③ Accessory

-Standard Acc.

-Optional Acc.

-전원

④ 설치조건

우리원 지정장소 현장 설치

⑤ 납품기한

보증기간 등

납품기한 : 계약일로부터 90일 이내

보증기간 : 납품일로부터 3년간

년 월 일

작 성 자

소 속 :

에너지공학과

성 명 :

허수미

계정(과제)책임자

소 속 :

에너지공학과

성 명 :

허수미